分居离婚可以通过两种主要方式办理： 协议离婚和 诉讼离婚。以下是具体的办理流程：
协议离婚
双方需就子女抚养、财产及债务处理等事项达成一致，并签订书面离婚协议。
双方携带身份证、户口本、结婚证、离婚协议到婚姻登记机关提交离婚登记申请。
申请提交后，需等待30天的冷静期。
冷静期结束后，双方再次前往婚姻登记机关领取离婚证。
诉讼离婚
一方向法院提交离婚起诉书及相关证据，如分居协议、租赁合同、往来信函、居委会证明等。
法院会先进行调解，若调解无效且分居满两年，确认感情破裂，判决准予离婚。
为证明因感情不和导致分居满两年，需准备相关证据，如分居协议、租赁合同、居委会证明、证人证言等。
法院审理离婚案件，进行调解无效后，若符合离婚条件，将判决准予离婚。
注意事项
分居离婚的关键在于证明因感情不和导致分居满两年，这是判决离婚的重要法定理由之一。
分居必须是连续的，并且已满两年。
协议离婚和诉讼离婚两种方式任选其一，若协商不成，可选择诉讼离婚。
建议：
如果双方能够协商一致，建议选择协议离婚，因为这种方式更加快速且流程相对简单。
若一方不同意离婚或协商无果，则需向法院提起诉讼，在此过程中应准备充分的证据以支持自己的主张。
